Астраханская городская территориальная организация Профсоюза работников народного образования и науки Российской Федерации создана в 1994 году. Возглавила организацию Афанасьева Наталья Александровна.

В 1996 году организация была зарегистрирована. В состав организации на протяжении многих лет входили 4 районные организации, которые в конце 2014 года были реорганизованы. Городская организация профсоюза самая многочисленная организации в Астраханской области. В настоящее время в ее состав входят более 160 первичных профсоюзных организаций с численностью членов профсоюза 7316 человек. Выборным коллегиальным постоянно действующим руководящим органом является Совет городской организации профсоюза, состоящий из 47 представителей профсоюза. Президиум избран в количестве 11 человек. Представители городской организации профсоюза входят в состав Президиума и Комитета областной организации профсоюза образования, областной отраслевой трехсторонней комиссии по регулированию социально-трудовых отношений в сфере образования. За свою плодотворную деятельность городская организация профсоюза и ее руководитель неоднократно награждались профсоюзными наградами. В 2010 году организация отмечена Почетным дипломом ФНПР «За активную работу по защите социально-трудовых прав и интересов работников», в 2014 году знаком Астраханского объединения организаций профсоюзов «Общественное признание», Почетными грамотами Центрального Совета Профсоюза и Астраханской областной организации профсоюза образования. Члены профсоюза активные участники акций, форумов, конкурсов, проводимых Профсоюзом. Ежегодно городской организацией профсоюза проводятся обучающие семинары для председателей профсоюза и руководителей образовательных организаций, организация оздоровления и отдыха работников образования и их семей. В городской организацией профсоюза налажено социальное партнерство. На территории города действует муниципальная трехсторонняя комиссия, подписано территориальное соглашение на 2015-2018 годы.

По результатам деятельности и рейтинга за 2016 год, решением Президиума областной организации Профсоюза Астраханская городская территориальная организация профсоюза образования занесена в Книгу Почета Астраханской областной организации Профсоюза образования.